Kişisel profil
Parmak izi
- 1 Benzer Profiller
Son beş yıldaki işbirlikleri ve araştırma alanları
-
A multi-stage computational pipeline and in vitro validation for the discovery of small-molecule translation inhibitors targeting the bacterial ribosome
Yuce, M., Koman, E., Sungur, F. A., Yazgan-Karatas, A. & Kurkcuoglu, O., 2026, In: RSC Advances. 16, 20, p. 18359-18373 15 p.Araştırma sonucu: Dergiye katkı › Makale › bilirkişi
Açık erişim -
Computationally Efficient Network Models Successfully Predict Allosteric Sites of SARS-CoV-2 Main Protease and Reveal Its Dynamic Allostery
Yuce, M. & Kurkcuoglu, O., 2026, (Kabul Edilmiş/Basında) In: Proteins: Structure, Function and Bioinformatics.Araştırma sonucu: Dergiye katkı › Makale › bilirkişi
-
A Computationally Efficient Method to Generate Plausible Conformers for Ensemble Docking and Binding Free Energy Calculations
Güner Yılmaz, Ö. Z., Doruker, P. & Kurkcuoglu, O., 11 Ağu 2025, In: Journal of Chemical Information and Modeling. 65, 15, p. 8137-8157 21 p.Araştırma sonucu: Dergiye katkı › Makale › bilirkişi
Açık erişim1 Atıf (Scopus) -
Graphene oxide-based and porous nanocarriers for drug delivery developed with computational and experimental approaches
Güner-Yılmaz, Z., Kocaaga, B., Yılmaz, A., Balcik, M., Kurkcuoglu, O., Sungur, F. A., Yavuz, R., Karatepe, N., Tatlier, M., Sirkecioglu, A., Hooshmand, S., Miavaghi, M. A., Zabara, M. A., Yürüm, A., Bayazıt, M. K., Batirel, S. & Güner, F. S., 1 Kas 2025, In: Surfaces and Interfaces. 76, 107860.Araştırma sonucu: Dergiye katkı › Makale › bilirkişi
-
In Silico Identification of Putative Allosteric Pockets and Inhibitors for the KRASG13D-SOS1 Complex in Cancer Therapy
Sarica, Z., Kurkcuoglu, O. & Sungur, F. A., Nis 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 7, 3293.Araştırma sonucu: Dergiye katkı › Makale › bilirkişi
Açık erişim1 Atıf (Scopus) -
Investigating the functional dynamics of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase upon ligand binding at the putative allosteric binding sites
Yuce, M. & Kurkcuoglu, O., 1 May 2025, In: Biophysical Chemistry. 320-321, 107420.Araştırma sonucu: Dergiye katkı › Makale › bilirkişi
-
A computational workflow to determine drug candidates alternative to aminoglycosides targeting the decoding center of E. coli ribosome
Yuce, M., Ates, B., Yasar, N. I., Sungur, F. A. & Kurkcuoglu, O., Eyl 2024, In: Journal of Molecular Graphics and Modelling. 131, 108817.Araştırma sonucu: Dergiye katkı › Makale › bilirkişi
4 Atıf (Scopus)
Projeler
- 12 Sonuçlanan
-
Rezidü Etkileşim Ağyapı Modeli ile GPCR Yapılarında İlaç Bağlanma Bölgeleri Tahmininin İstatiksel Analizi
Levitas, A. Ö. K. (PI)
16/04/24 → 16/10/24
Proje: BAP
-
GAPDH Enzimi Allosterik Bölgelerine İlaç Bağlanmasının Protein Dinamiğine Etkilerinin Ön Görülmesi
Levitas, A. Ö. K. (PI)
26/12/23 → 26/09/24
Proje: BAP
-
Bakteriyel Ribozom İnhibisyonu için İlaç Tarama Çalışmaları ve Farmakofor Tasarımı
Levitas, A. Ö. K. (PI)
23/05/23 → 23/05/25
Proje: BAP
-
YapıTabanlı İlaç Tasarımında Karışık Çözünürlüklü Elastik Ağ Modelinin Kullanılması
Levitas, A. Ö. K. (PI)
18/04/23 → 20/04/26
Proje: BAP
-
Rezidü etkileşim ağ yapı modeli ile allosterik ilaç bağlanma bölgelerinin tahmini
Levitas, A. Ö. K. (PI)
1/03/23 → 1/09/23
Proje: BAP
Ödüller
-
15th European Symposium on QSAR Molecular Modeling, En iyi poster ödülü
Levitas, A. Ö. K. (Alıcı), 1 Haz 2004
Ödül